
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱微生物 为其提供 TMT蛋白质组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探索没想到
研究分析成员研究性学习跟随着食品速冻时段延长至至羊肉的抗拉强度、持反击式水轮机、色彩、分散铁占比、ROS、脂质过脱色物、MDA、GSH和GPX4关卡来考核肌肉群组织化細胞的铁自杀形态。结杲显现,食品速冻时段延长至至后,羊肉的抗拉强度在第六天和第6天有效增涨;持水效果降;有颜色变深,失却光滑,鲜朱色转换成暗朱色。除此之外,分散铁、抗逆性氧和MDA的占比有效增高,細胞凋亡率有效偏高。 探索员工转化成有所其他于食品冷藏用时的身体腹肌样板的蛋清质,随后实行SDS-PAGE数据具体分析,蛋清质条带在有所其他于末期分布图制作不均且相同(图1a)。基于蛋清在有所其他于样板中的表明条件,数据具体分析发掘指定组样板的中五位数靠近于指定关卡(图1b),就说明身体腹肌样板蛋清质拥有积极的组内相同性和组间不同性。 淀粉酶质组学共签定出1996种淀粉酶质。以B0为剖析组,需求B1、B2、B4和B6中的淀粉酶来异同形容方式定性定量分析,共签定到376个DEPs。将火山图可视化数据,并基于FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两种的标准定性定量分析DEP。毕竟长为1c-f如图所示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分发型别签定出22、33、73和140个DEPs,这其中分发型别上浮6、11、32和84个,下降16、22、41和5二个。聚类分析法的方法鉴定了对比冷冻箱关键期肩部腿部肌肉结构中淀粉酶质的形容方式,毕竟彰显肩部腿部肌肉淀粉酶形容方式异同伴随着处理日期的加入而加入(图1g)。
图1| 有差异冰箱时刻的肌肤样板蛋白酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 各种不同冷库日子的肌肤样本距离淀粉酶研究(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁去世血清肽的PRM降钙素原检测剖析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 基本概念KEGG含有相互影响描述球蛋白的铁阵亡长效机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物学提供了TMT参考值淀粉酶质含量质组学枝术服务质量项目,拜谱微生物已研制开发完毕并构建了改善成孰的转录组学、淀粉酶质含量组学、代谢率组学及其两组学协同车辆枝术服务质量项目机制,欢迎致电咨询!
参考资料文献综述:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.