
2023年4月2日,西班牙科尔多瓦大学Tomas Cerdo等人在Cell Host & Microbe(IF=30.3, 2023)杂志发表了题为“Infant gut microbiota contributes to cognitive performance in mice”的文章。研究人员使用16S rRNA测序、宏球蛋白质含量组学和产生组学定性分析揭示了婴儿认识和肠道菌群之间的联系。结果显示认识能力较好的婴儿肠道菌群可以增强小鼠的记忆,并调节了小鼠外周血皮层(PRC)的组氨酸代谢组,这些结果表明“肠脑轴”在婴儿时期就起到至关重要的作用。
日语一级标题:Infant gut microbiota contributes to cognitive performance in mice (Cell Host & Microbe,IF=30.3, 2023)
中文名字标题文字:婴儿肠道微生物群有助于小鼠的认知表现
组学新技术:16S rRNA+宏蛋白质组学+代谢组学
子样本信息:婴儿粪便、小鼠粪便
科研思维
(图源:Tomas Cerdo, et al., Cell Host & Microbe. 2023)
首要论述但是
01、新生婴儿认知效率和直肠菌群架构的关心
首先,研究人员基于贝利婴儿发育量表(BSID-III)数据,根据6个月大的婴儿在复合认识、语言和运动三个领域的得分,将婴儿分为高于中位数组和低于中位数组。通过对婴儿粪便样本进行16S rRNA分析,发现唯一与肠道微生物群落结构密切相关的BSID-III量表是复合认识(CC)。 与远低于CC中数字组(Inf-belowCC)的婴孩相对,高与CC中数字组(Inf-aboveCC)的婴孩肠胃菌群含有更多的不规则性( 图1A)。在属水平上,Inf-aboveCC组的肠道菌群中杆菌、链球菌、拟副杆菌、严格感梭菌、霍氏杆菌和瘤胃球菌富集,而无毛螺科、嗜血杆菌和乳球菌的显著减少(图1B-D)。上述结果表明, 掌握本事有所对比的宝宝,其消化道微生物检测制品在群落构成特证上的存在同质性对比 。
图1. Inf-aboveCC和Inf-belowCC组新生宝宝胃肠菌群聊成的结构
02、幼儿认清力重要性的宏淀粉酶质组表现形式
为了探究与婴儿认识相关的肠道菌群功能特征,研究人员采用宏血清质组学对婴儿粪便进行分析。结果表明,Inf-belowCC组的肠道菌群富含参与细胞内运输分泌和囊泡运输的蛋白质,而Inf-aboveCC组中参与碳水化合物运输和代谢的蛋白质有增加的趋势。稀疏偏最小二乘判别分析(sPLS-DA)图显示,婴儿宏蛋白质组(图2A)和促进区分的已鉴定蛋白质组(图2B)之间存在明显区别。组氨酸酶(HutH)是Inf-aboveCC宏白质组中独一无二相关系数生物富集的营养物质质。随后,研究人员通过DESEq2差异丰度分析(图2C)和Wilcoxon检验进一步证实了上述结果,组氨酸分解代谢的两种下游酶尿糖酸脱水酶(HutU)和咪唑酮丙酸酶(HutI)在Inf-above CC宏蛋白质组中丰度较高。上述分析结果揭示了与婴儿认识能力相关的宏蛋白质组特征。
图2. 宏核蛋白组学丰度概述
03、组氨酸分解代谢与婴孩认同效果相关
宏蛋白质组学数据和生化实验结果表明婴儿组氨酸代谢与认识能力相关,因此,研究人员开发一种靶点细胞代谢组学方法用于定量分析组氨酸代谢物水平(图3A)。结果表明Inf-aboveCC组婴儿粪便中的尿酸盐水平显著降低,而其余组氨酸代谢物则无差异(图3B)。研究人员进一步检测了婴儿尿液中的组氨酸代谢物,结果显示与Inf-belowCC相比,Inf-aboveCC组婴儿尿液中组胺、组氨酸和尿酸水平显著升高(图3C),且Inf-aboveCC组粪便中的尿酸盐/组氨酸比值(图3D)和尿液中的组胺/尿酸盐比值(图3E)显著降低。粪便中的尿酸盐/组氨酸比值与unclass_lachnospirace_41和Lachnospiraceae incertae sedis属呈负相关,与Bacteroides_3呈正相关(图3F)。尿液中的组氨酸水平与Streptococcus_42和Bacteroides属呈正相关,而尿酸水平与Holdemanella_16呈负相关,与链球菌属呈正相关(图3G)。
图3. 组氨酸产生与宝宝的了解专业能力有关
04、宝贝供体的肠内菌群小鼠种植
最后,为了调查肠道微生物群是否有助于认知,研究人员进行了一项粪便微生物群移植(FMT)实验。结果表明,将Inf-aboveCC供体的粪便移植到GF小鼠体内,其记忆功能优于Inf-belowCC供体的小鼠(图4)。被婴儿肠道菌群定植的小鼠拥有与记忆功能相关的不同细菌分类群,认知表现较好的婴儿微生物群小鼠表现出更高的记忆功能,包括Phocaeicola, Bacteroides和Bifidobacterium物种在内的丰富分类群以及不同的组氨酸代谢组学特征(图4B),其中,毛缕菌科和拟杆菌类与婴儿认知的关联在人源化小鼠中得到了复制。此外,与接受Inf-belowCC肠道微生物组的小鼠相比,接收Inf-below cc肠腔微生物学工程组的小鼠HutH特异性恰恰更好。总之,这些结果表明通过婴儿供体的肠道菌群粪便移植的记忆功能可以传播给GF小鼠,表明肠道菌群可以作为一种促进记忆的实体。
图4. 被宝贝胃肠道菌群定植的小鼠具有与背诵能力涉及到的的多种结核杆菌进行分类群
总结ppt
上述情况,研发职工完成16S rRNA测序、宏蛋白质含量质组学和基础排泄组学介绍建设了宝宝组氨酸基础排泄组与自我看法互相的保持联系,高并发现打了个个与看法力量想关的的基础排泄酶—组氨酸酶(HutH)。HutH技术含量的文化差异及不一样的粪水和小便组氨酸基础排泄组与宝宝自我看法想关的。另外,完成宝宝供体的消化道菌群粪水种植后的记录功效就能够营销给没有日常细菌小鼠,看法力量良好的宝宝供体种植后小鼠食含Phocaeicola, Bacteroides和Bifidobacterium等与自我看法力量想关的的日常细菌。研发认为宝宝黏结自我看法和消化道菌群聊成互相的关系最早的在6月时就建设起来了了,组氨酸基础排泄物技术含量的控制是一个种隐藏的的策略。拜谱总结
本研究通过16S rRNA测序和宏膳食纤维质组学分析使组氨酸酶在婴儿认识中的作用脱颖而出,并通过代谢组学和粪便移植的方法进一步验证,多方面讲述了在小宝宝-畜禽粪便移植成功小鼠采集体系中肠胃菌群对了解业务能力的直接影响,为“肠脑轴”在小宝宝一时期的进展和帮助机理给予了新的能够理解。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供蛋白质组学、代谢组学、修饰组学、16S rRNA测序等多组学技术,结合组学技术拜谱生物也推出了针对不同样本和研究领域的多组学研究方案,包括肠道篇、血液篇、医学篇等,帮助客户解决研究难题,助力多篇高分文章的发表,欢迎大家咨询!
参考使用资料:Tomas C, Alicia RR, Inmaculada A, et al. Infant gut microbiota contributes to cognitive performance in mice. Cell Host & Microbe. 2023, 31(12): 1974-1988. doi: 10.1016/j.chom.2023.11.004.