经验简绍

共建躯干策划 的表观遗传表示图谱常受限制于身心健康样例量的添加。往昔调查多用于脑牺牲捐献器官者或皮肤疾病割除策划 旁的"挨近常规"策划 ，但这种样例量会有梗死、新陈代谢失常或皮肤疾病微区域干挠等间题。

2026年4月，国际顶级期刊《Nature》发表了题为“A spatial atlas of the healthy human liver from live donors”的突破性研究，该研究通过区域转录组学（Visium、Visium HD、MERFISH和PhenoCycler 成像）与单癌细胞质RNA测序（snRNA-seq）的深度整合，系统揭示了活体健康人肝的空间表达蓝图，并发现人类肝脏中央区功能相较于小鼠及其他哺乳动物存在明显差异。本研究为健康人类肝脏提供了空间基因表达参考框架，并深入揭示了早期脂肪变性过程中肝细胞的变化机制。

空间转录组学

体现活体健康生活供肝的显著转录组特证

研究团队首先通过Visium房间转录组学系统解析了16例肝脏样本的转录组特征，包括8例活体健康供肝（LHD）和8例病理旁"邻近正常"组织。在44,243个高质量spots中，研究发现活体健康供肝与邻近正常组织在伪批量表达谱上明显分离：健康供肝高表达肝细胞功能基因，包括尿素循环酶（ASS1）、药物代谢酶（CYP2E1）和糖异生基因（PCK2）；而邻近正常组织则高表达免疫相关基因（S100A8、S100A9）和应激基因。线性混合回归模型显示，"样品形式"是什么是基因表现变种的核心驱程客观因素，其效应超过年龄、性别和组织学评分。这一发现警示：传统病理旁"正常"组织可能存在系统性偏差，活体健康供肝才是建立真正健康参考标准的理想选择。

图1 人类历史和辅乳期小动物肝或其他排毒器官的办公空间呈现图谱

Visium HD & MERFISH

抽象化肝小叶门静脉注射

中央军事静脉血管轴的高效化区别图谱

利用CYP2E1等标志基因构建分区指数，研究团队将肝小叶划分为15个档次。在1,724个肝细胞特异性基因中，1,14一（66%）呈现出正相关的系统分区不同之处。中央静脉区富集外源物质代谢（CYP2E1）、胆汁酸合成（CYP27A1）和脂质合成（FASN）基因；而门静脉区则高表达免疫相关基因（CRP、SAA1）和经典糖异生基因（PCK1）。挑战性得知：人类特有的线粒体糖异生基因PCK2和葡萄糖转运蛋白GLUT2（SLC2A2）均呈中央静脉区富集，直观对战了老式认同糖异生限于门静脉注射区的认识论。Visium HD与Visium数据验证这些分区模式（Spearman R=0.70，P<10⁻³⁰），MERFISH在500个基因上进一步独立验证了分区模式。

图2 肝人体细胞基因组传达设计布局

跨植物物种三维空间转录组学

蕴含人肝区别模式英文的植物物种特情人

研究团队生成小鼠（n=6）、野猪（n=2）、家猪（n=3）和牛（n=2）的空间转录组数据，进行系统比较。主要结论：人与小鼠的分区偏倚相关性较低（R=0.15，P=5.18×10⁻²⁵），存在大规模功能偏移。人类中央静脉区显著富集尿素循环酶（OTC、ASL、NAGS）、脂肪酸合成酶（FASN）及转录因子HNF4A（在小鼠中为门静脉区富集），而这些功能基因在小鼠中多呈门静脉区富集。更意外的是，与猪、牛等大型哺乳动物相比，人肝中央静脉区功能多样性仍显著更高。既然WNT信号灯信号通路的区域策略在因此植物外来物种中传统，但人们中心地方区职能的特点偏斜会由产生率、抗生素梯度方向等植物外来物种非特异朋友原则驱程，提示小鼠模型在研究人肝脏代谢疾病时可能存在系统性局限。

图3 蒲乳期爬行动物中间独家和主体的区别方式

snRNA-seq & Visium HD

讲解非原因组织细胞的服务器系统分割及互作手机网络

通过snRNA-seq（67,000+个上皮细胞结构）结合Visium HD空间定位，研究团队构建了成纤维细胞、Kupffer细胞、肝窦内皮细胞等非实质细胞的分区图谱。与小鼠有差异，人肝Kupffer肿瘤细胞呈中间区含有，可能与其清除高代谢活性中央区死亡肝细胞的功能相关。进一步分析发现多个分区特异性配体-受体互作对：中央区LSECs来源的WNT2与肝细胞FZD5及成纤维细胞FZD1受体互作；成纤维细胞和LSECs表达的RSPO3与肝细胞LGR5和LGR4受体共分区。这些结果为理解肝内分区特异性信号通讯提供了重要资源。

图4 肝脏等非本质特征组织细胞的设计布局

机借鉴&两组学梳理

阐释之前蛋白质性质发生变化中的线粒体代偿危害

在表现为轻度脂肪变性（<20%）的健康供肝中，MASLD 脂质积累起始于中央静脉区。研究团队利用POS机学对H&E画面采取分辩率级脂滴按量，将中央静脉区spots按脂质含量分为5个梯度。结果显示：随着脂质增加，脂质摄取/合成基因（SLC27A3、DGAT1）下调，而β-氧化（DIO1、HSD17B4）和脂质分泌（ABCB4）基因上调——提示肝细胞试图通过增强线粒体氧化能力限制脂质堆积。关键提示：核编码线粒体蛋白基因（如NDUFA9、NDUFS4、NDUFS8）表达下降，而线粒体自身编码的RNA（MT-ND1、MT-ND4L）却代偿性上升。这种核-线粒体基因表达失衡可能是未来脂毒性的潜在机制之一，为MASLD（代谢相关脂肪性肝病）早期干预提供了全新靶点。

图5 人体脂肪退行肝体细胞基因组展现的各式各样发生变化

拜谱个人心得体会

本深入分析成功失败搭建了从"样板得到→余地图谱→跨鱼类更→受损细胞互作→患病机理"的完正论述皮带轮，按照几组学水平打碎了"身心稳定较要用病症旁组织机构替代品"的传统意义自我认同，立即明晰活体身心稳定供肝做为"团伙对比细则"的重要位置，为能够理解胰腺划分的功能的外来物种特喜欢的人提高了范式。拜谱生物学退出时间多个学数据分析的服务，惊现"面积异质性-癌细胞互作-病规则"关联关系研究分析的基本点供给，构建多个学检测工具、广度扩大：面积转录组（Visium/Visium HD）、单神经细胞测序（scRNA-seq/snRNA-seq）、靶点消化吸收组及球蛋白组学的全程序解决方法策划方案，带来从在线检测到概述的全程序提供服务，力助医学检验实验走入新过程。受欢迎网络咨询！

考虑学术论文

Yakubovsky O, et al. A spatial atlas of the healthy human liver from live donors, Nature (2026), //doi.org/10.1038/s41586-026-10377-y