
近日,无锡医科高校第一点附设宠物医院王学浩教授团队协作在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,血清互作组和靶向药物精力细胞代谢检测分析服务。
英文音标题目:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文名字名称:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
老客户方:南京医科大学
深入分析的原材料:细胞
拜谱提供数据业务:转录组测序+蛋清互作组+靶点势能基础代谢组
技术设备自驾线路:
探讨效果
01、YBX1被签定为HCC中糖酵解的重要的表观遗传
本理论研究录入HCC癌症范例(n=7)的单肿癌癌症组织RNA测序数据信息资料集确认深入进行探讨,察觉到糖酵解灵活性包括聚焦在癌症肿癌癌症组织中,hdWGCNA深入进行探讨判别出9个表观遗传功能(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的经营深入进行探讨确认YBX1为自立经营危害性重要因素(图1H)。进每一步结合在一起IHC、WB工作和癌症企业机构与相临非癌症企业机构的空间区域转录组学数据信息资料集证明YBX1是肝肿癌癌症组织癌治療的潜在的靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被敲定为设定HCC受损细胞糖酵解的要素各种因素
02、YBX1带动HCC中的有氧糖酵解和增值能力
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向药物动能基础代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1利于HCC中的有氧糖酵解和繁衍
03、OGT与YBX1整合并提高YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋清互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1根据并可以淡化YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化开展其磷硝化作用,故而提高网站其核转位
下两步一个脚印测试YBX1的O-GlcNAc糖基化是否有后果其磷硝化作用,在OGT敲低的HCC组织細胞中或用OGT缓和剂OSMI-1处里,YBX1球球血清的总体水平面取得消减,YBX1磷硝化作用取得避免(图4A-C)。IP实验所表示,在一致的Flag-YBX1底物的总体水平面下,YBX1-WT的磷硝化作用的总体水平面取得高与YBX1-T57A,证明磷硝化作用的增长不单单仅是正因为比较高的YBX1球球血清表达出出来(图4D)。分離了核和质多组分遇到TMG处里的HCC组织細胞中YBX1核表达出出来的身高(图4E-F),下两步一个脚印遇到YBX1磷硝化作用的关键点缓解要素是AKT(图4G-I)。以下遇到注重O-GlcNAc糖基化根据驱动其磷硝化作用来加强YBX1球球血清平稳性并驱动核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 遮盖不利用其进一部形成磷过酸遮盖并都可以利于其核转位
05、YBX1利于PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1提高PKM2转录
06、YBX1 就可以的提升组血清乳硝化作用绘制程度
探讨知道YBX1敲低明显减少蛋清质乳碱化,愈加是H3K18乳碱化(图6A-C)。糖酵解控药品2-DG的试验灵魂现实存在了糖酵解与组蛋清乳碱化的随便关联关系,控制糖酵解可明显减少H3K18la平行(图6D)。PKM2过表达方法爱可逆性转YBX1敲低所导致的H3K18la减低,以外源乳酸治理 不光升降H3K18la,还陪伴YBX1表达方法爱上浮,显示系统现实存在正在向反馈意见(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR灵魂现实存在,H3K18la采用丰度于YBX1启动服务器子随便力促其转录,该方式受O-GlcNAc糖基化调整(图6H-J),并知道P300 上浮是YBX1开展H3K18乳酰化做用的新机制(图6K-L)。
图6.YBX1提升H3K18乳过酸体现总体水平
散文工作小结
在本身探索中新闻稿件了YBX1在HCC中高表答,可以与糖酵揭秘切重要性。YBX1在T57处被O-GlcNAc淡化,可以维持脂肪酸质并曾加其表答。本身淡化还利于YBX1在T57处的磷酸性反应,利于其核易位。所以,某种全过程减弱了糖酵解重要性人类人类基因的转录并伤害性乳酸的呈现。另外,YBX1激活码P300的转录,因此驱动程序组脂肪酸的乳酸性反应,相当是H3K18la,H3K18乳酸性反应单向国家宏观调控YBX1人类人类基因转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传性正反两面馈环管理机制图
拜谱个人心得体会
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物制品为该研究提供了转录组测序,淀粉酶互作组和靶向疗法正能量产生组技术服务,拜谱生物体建立了完善成熟的转录组学、核蛋白组学、翻譯后装饰组学、产生组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
学习文章
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.