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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 网络数据药剂学学具体分析草酸钙肾结石硫化应激反应和支原体感染断裂缘由

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿设备最喜欢见的疾患其一。肾组织性中CaOx晶状体过饱和累积会会导致肾小管細胞影响和凋亡,为了会导致肾结石的演变成。短链皮下皮脂酸由胃肠内水解酸化池杆菌发醇伙食玻璃纤维出现,不仅仅在部位胃肠深层中起做用,特别在设备关卡上也起关键性做用。在当中,丁酸是最充实的短链皮下皮脂酸,兼有免疫细胞可抑制和免疫细胞可抑制做用,本实验研究综述丁酸对CaOx肾结石的做用极其不确定靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山医疗机构泌尿急诊科吴忠副教授、周子健硕士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教学、周子健研究生在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生态学与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了网路药学学安全服务,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

优秀文章明称:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 老客户组织:华山医院专家 科学研究人群:大鼠、HK-2组织 分组名称信息查询:照表组(Con)、模特组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱可以提供技艺:网络信息药理学学检查

思维工艺流程

调查结论

理论研究方案的人员应当整合大鼠模式,实现生理学什么是生化指数公式和公司病理报告学上色等理论研究方案技术看见丁酸不错减低CaOx模式大鼠肾CaOx氯化钠晶体的养成和受伤,可以改善CaOx模式大鼠的支原体感染受伤和氧化反应的化合物的过渡传达。最后,丁酸还可调节草酸成脂的HK-2受损細胞受伤、氧化反应的应激反应和受损細胞凋亡。 为探讨丁酸架构和靶表观遗传线上上的数据资料信息,科学研究人工从PubChem拿丁酸和丁酸酯的二维和三维空间架构(图1A)。在PharmMapper的数据资料信息库和Uniprot的数据资料信息库处置后共淘汰出11七个丁酸靶表观遗传供进的一步剖析。将表观遗传汇总使用STRING的数据资料信息库,确定PPI线上上的数据资料信息剖析。Cytoscape提出了顺序排列的前20的核心区站靶表观遗传的详细说明书怎么写线上上的数据资料信息图,还包括CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。以下核心区站表观遗传与线上上的数据资料信息中的各种表观遗传均表现形式出很大的关干系的性,说明书怎么写以下表观遗传有可能会利用着协同作战的功效。GO和KEGG剖析揭露了丁酸核心区站表观遗传的关干系的路径和生命科学学的功能(图1C)。核心区站表观遗传主耍与类固醇抗生素回话、硫化应激性性回话、活力性氧细胞系对类固醇抗生素兴奋的反應及其对偏酸电化学材料的反應关干。笔者认为经验,以下核心区站表观遗传主耍参加了硫化应激性性和对活力性氧的生命科学反應阶段,是肾结石建成策略中至关为重要性的路径,这表达丁酸有可能会在肾结石中利用为重要性的功效。

图1| 丁酸结构类型与靶dna电脑网络数据分析(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一个步骤探究丁酸对CaOx肾结石确实切靶DNA遗传,探讨工作员利用率GEO统计资料显示信息库对GSE73680中键康对应与CaOx肾结石提高的DNA遗传地域差异去了探讨。对应组与CaOx结石提高的同质性性地域差异形容DNA遗传(DEGs)需求准则为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共需求到3783个DNA遗传时有发生同质性转变,之中3379个(89.4%)DNA遗传形容调涨,404个(10.6%)DNA遗传形容调低(图2A)。对DEGs去聚类算法分享分享,热图显示信息了前10个被选中DEGs的二维层次结构聚类算法分享特征英文(图2B)。马上又,探讨工作员使用GeneCards统计资料显示信息库人工客服电话鉴定结论了370个可能会与CaOx肾结石涉及的DNA遗传,的排名前20位的分析DNA遗传下列关于涉及性评分系统如图是2C如图所示。成了找丁酸手术治疗CaOx肾结石的至关重要靶点,探讨工作员将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石涉及DNA遗传补救能够得到好几个个Venn图。终极,CYP2C9被选定为丁酸引响CaOx肾结石的隐性靶点(图2D)。与此同时,探讨工作员还去了丁酸与CYP2C9的原子连通,CYP2C9的六个碳水化合物残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸之间功用,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在利用率网临床药理学推测CYP2C9是丁酸后果CaOx肾结石的靶DNA后,设计的人员还采用血受损细胞实验操作核实了CYP2C9可降草酸帮助的HK-2血受损细胞的ROS平均水平、支原体感染伤到和凋亡。

图2| 许多据库协力概述予测CYP2C9是丁酸反应于CaOx肾结石的靶dna

的研究后果

本探索应当发展丁酸在身上和身上均能可以抑止CaOx肾结石绘图的被氧化物应激状态反应和细菌感染问题,然后使用微信wifi网络药剂学学淘汰获取丁酸引响CaOx肾结石的自身靶点——CYP2C9,到最后使用肿瘤神经细胞实验操作灵魂存在CYP2C9在草酸盐成脂的HK-2肿瘤神经细胞ROS总体水平、细菌感染问题和凋亡。等发展表述丁酸将会使用可以抑止CYP2C9来可以抑止CaOx肾结石的被氧化物应激状态反应,可减轻细菌感染问题。某一全过程中拜谱海洋生物工程能提供了微信wifi网络药剂学学工艺提供保障,前者拜谱海洋生物工程可提高了稳重落实的什么是基因组学、球胆固醇组学、产生组学等两组学软件及工艺提供保障,追捧拨通咨询服务! 符合医学文献:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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