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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

直作煤化工配料而被知道的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“消化吸收垃圾”已成为“藏宝图小氧分子”的心酸以来一样,陪你到近10好几年才被挖掘其至关重要的生物技术学性能,从“侧睡农奴把合唱”,相当是在抗体细菌感染性急病研究探讨方向内异军突起。另一几篇文献资料新闻报道了在各种各样的细菌感染性急病的小动物建模中赋予衣康酸或其有机化学表达ip产业物技术的根治益处,并挖掘其隐藏的靶点。相对于衣康酸的“今身来世”与“今身”,详细文案《乳酸的奋斗史小哥——衣康酸!这篇一起去流浪了解一下衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用遮盖蛋清组学产品,实现1000+什么难以理解的度修饰语位点验出,稳固逆转原素靶点,全定位生信了解解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“发觉”到“验正”全步骤流程售后服务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、科学实验注意事项

02、场地实测数值

03、经“点”逆转

在测试资料资料中,查出俩个论文资料中报到的精品靶点下列不属于衣康酸淡化位点,如最个被知道的衣康酸共价淡化血清KEAP1,另外 糖酵解环路中的3个重要酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,各类炎性小体组合而成血清NLRP3和受损细胞细胞坏死时中的重要血清RIPK3等,其质谱图以下的图图示。

04、厂品作用

1.诸多质控

商业圈化特情人电极孵育、SDS-PAGE检查、WB核验、模板重要性性解析等多多位检查,保证 大型项目结论靠得住性。

2.高耐腐蚀性质谱实验室设备软件平台

在Orbitrap Astral全新这一代高识别质谱仪作明佛母心咒下,改变衣康硝化作用体现位点及蛋清鉴定费新广度,助推科学技术钻研发现。

3.全流程步骤一坐式工作

为拜谱生态学全面的实验室平台网站,可能提供“内部培养出→测试探针孵育→WB的探测→艰深度衣康碱化呈现的探测→个性化生信讲解→单一位点PRM手机验证”全流程步骤服务管理,省时省时省力更省时。

05、阐述东西(部位)

06、选用朝向

PART 2、医学文献说说

论文资料一

英语怎么说版头:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

英文版题目:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

理论研究内部:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

医学文献二

日文题目:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

汉语主题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

论述信息:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、装修案例衍生物难点

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13享有较少的底物紧密联系意识,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生态学衣康碱化遮盖组测评大数据中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康过酸表达(下面的图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱总结ppt

看做TCA再循环中的正中间细胞基础分解代谢物,衣康酸调细胞基础分解代谢、免役和感染间的互相做用,为调理免役感染性病提高了混用调理原则。衣康酸格局的中的亲电性α,β-不是处于饱和状态羧酸格局的能对血清质上的活性酶类半胱氨酸残基做好烷基化突显(迈克尔暴击伤害体现),这样翻泽后突显被是指“衣康酸突显(itaconation)”,因而影响力血清质用途,控制免役初次应答和细胞基础分解代谢前提条件,为很多病口服药物研发项目管理提高新方法。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用遮盖血清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医药学绝一定量靶向治疗代谢率组(QMT1000)或能量转换基础代谢转化靶向药物基础代谢转化组服务对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

参考选取文章

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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