在人类细胞中，DNA充满了组蛋白、RNA和染色质相关蛋白，形成粘性凝胶。在任何给定时刻，只有蛋白质组的一个子集可以结合DNA并组织其结构、转录、复制、修复和其他基本分子功能。2025年5月22日，德国弗赖辛慕尼黑工业大学（TUM）生命科学学院Bernhard Kuster团队在Cell（IF 45.5）杂志上发表了题为“The human proteome with direct physical access to DNA”的研究文章，开发了一种“零距离”光交联方法来定量与活细胞中DNA直接接触的蛋白质，这为探索基因组调控开辟了一条直接途径，适用于许多生物体和系统。

科研结杲

1、从光敏培养出生殖细胞中领取DNA热塑球氨基酸

关键在于溶合光热塑核营养素-DNA结合物采用LC-MS参与定性分析，笔者联合开发一堆种性变纯化工作方案，可从DNA中去否则热塑核营养素，仅在照晒时根据间接dna组接触的面积丰度DNA热塑核营养素。用TRIZOL添加染色剂质并洗去落网获的非热塑核球球核血清，而后将其重复降解以参与RNase化解不好。根据超音波裁切获得的核营养素热塑DNA的添加物，在硫氰酸胍中煮开性变，并在二防氧化硅离心法柱上胸骨后疼痛洗衣以去否则热塑核营养素直实现。根据核酸酶治理 从DNA中增加光热塑核球球核血清，并参与胰核球球核血清酶化解不好采用LC-MS参与定性分析。该形式命名大全为核营养素热塑DNA添加或XDNAX。

图1.球蛋白质含量热塑DNA拆分或XDNAX工艺流程表（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

2、可直接的触碰DNA的蛋清质图谱

将光交连方式方法应用软件于MCF7生殖人体细胞，发展了1,805种侯选营养素质，中间1,191种产生于3个或非常多次多个中。60%的DNA之间反应组会有核酸通过的GO标注，在缺少核酸通过标注的营养素质质中，非常大的贡献奖来源核纤层营养素质，一方面是积极参与染色法质组织开展和生殖人体细胞裂开的营养素质质（图2）。

图2 . 可随便接触到 DNA 的核蛋白（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

图3归纳了DNA相互之间间功效组所蕴含的血清质-DNA画质还有其包含了的核苷酸化学交联肽。这涉及仍然（1）球状DNA融合设备构造域、（2）DNA 融合周期性区（IDR）和（3）仍然与另一血清质（比如说组血清融合血清）、RNA（比如说剪接系数）或相提取区室（比如说核仁血清）相互之间间功效而影响的环镜介于。

图3 . 可直接性接触的面积 DNA的组成部分域（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

3、参考值癌细胞扰动前几天与DNA综合的转录分子

雌抗生素肾上腺素受体α（ESR1）驻留到胞质溶胶中，知道会碰到其配体，启用易位到癌细胞核结构核，在哪点它与染色体组中的对应领域整合以激话对应的转录步骤。将血清饥饿的MCF7癌细胞核结构爆出于高摄入量雌抗生素（10 nM 17β-雌二醇）4两7分钟，与模以治疗的對照癌细胞核结构很这些的DNA互为目的组（图4A）。在这其中，雌抗生素刺激性后DNA互为目的组中的ESR1多了30倍（图4B）。总的来看，在1,814个酶联免疫法的血清质-DNA互为目的中，约有9%信息显示出超出2倍的同质性变，并了解到与ESR1包括互为目的的血清如POLR2A和SMARCA4等（图4B-C）。

图4 雌抗生素正确处理乳腺炎癌神经元 DNA 互为效用组的化学发光法会比较（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

工作小结

的理论研究方案进到刺绣体组的球营养物质以认知它是是怎样被识别并付诸实现的，长时是教育科研成员一家长时的完美追求。刺绣体组可及性其主要以DNA为核心的的角度展开的理论研究方案，尽管，到现如今就行，刺绣质妇科凝胶中的一些球营养物质与DNA 发生了力学相护之间反应尚不清晰。运行零相应光交连，可知道DNA相护之间反应组中的大部分数球营养物质，XDNAX工艺将身为球营养物质-DNA相护之间反应的理论研究方案的专业平台。

拜谱个人总结

该研究基于LC-MS/MS蛋白质谱开发的XDNAX技术，实现了活细胞内蛋白质与DNA直接相互作用的精准捕获与定量分析，绘制了高分辨率的人类DNA互作蛋白图谱，为解析基因组调控网络提供了全新工具。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司，可提供完善成熟的营养素质组学、掩盖组学、分解代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系，整合多组学数据进行深入挖掘分析，全面解析机制机理等，助力高分文章发表。欢迎咨询！

参考使用文章：

Trendel J, Trendel S, Sha S, Greulich F, Goll S, Wudy SI, Kleigrewe K, Kubicek S, Uhlenhaut NH, Kuster B. The human proteome with direct physical access to DNA. Cell. 2025 May 14:S0092-8674(25)00507-0. doi: 10.1016/j.cell.2025.04.037.