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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于抗体阳性动物群活性聊天、寡核苷酸突显的成本非常高或操控流量缜密。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯讲解微商团队在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个成本低的低、跨种类、全平台网站兼容的全新解决方案。

学术期刊简绍

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由国内国家科学性设计的院基因病的与骨骼发育生理学学深入分析所和国内国家基因病的能够承办的国际性学界杂志论文杂志,着力推进于简报性命科学性设计的和中医药学基因病的学的行业的国散文网性深入分析结果。JGG 2025年度影晌指数公式7.1,Scopus学界杂志论文杂志评测指数CiteScore 9.9,居首JCR 2025年度GENETICS & HEREDITY的行业Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY的行业Q1区,居首国内国家科学性设计的院杂志论文杂志系统分割生理学学大类目1区(Top杂志论文杂志),基因病的学和生化学与氧分子生理学学小类双1区。

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啥子是HEATag

比较巧妙的“二合并”设计构思

HEATag是由凝集素和HUH内切酶制成的结合血清

「精确定位器」模块图片 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化掩盖(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「无线电源连接器」引擎 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)字段方形码确定共价接触。

“1+1>2”的效率:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行模本标签与朔源。

Fig1: HEATag多大标出基本原理提示图

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实用技巧开展

HEATag又有大多能打?

能能在区别生活条件下,保持喂奶动物界肿瘤组织细胞系单肿瘤组织细胞混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。钻研人员为 HEATag 设置成了多轮 “阻力测式”,从组织系到组织核,从常溫到温度过低,从新鲜样板到不变样板,全八卦方位安全验证它的维持性和靠谱性。

第一点轮试验对于哺乳期间绿色神经元系:科研的人员进行了出于人、鼠、仓鼠5个植物外来外来物种的六种神经元(HEK293T、K562、MEF、CHO),在空调温度下要 HEATag 标出后分层测序。终于再利用的 11447 个神经元中,85.66% 都能依据 HEATag 条状码明确符合到原植物外来外来物种,样例间交叉式污染问题非常少,UMAP 聚类算法概述更马上证件,HEATag 条状码与植物外来外来物种特情人DNA组的特征间距同样。 随后,测试方法状况进那步升级系统:科研技术人员勇于尝试在 4℃下箭头清爽体体组织、在室内温度下箭头甲醇一定体体组织,有的直接性箭头体体组织核。的效果即使醒目:所有的状况下,样板性子与动物群图片信息均有着很棒的关于性,分割准确无误率超 95%。虽然甲醇一定会影响轻度的转录本对称影响,体体组织核化学合成有极少量 RNA 掉失,体体组织结构类型的注解的效果即使与清爽样板要保持同一,验证 HEATag 能够箭头各种办理状况下的實驗样板。

Fig2: HEATag 可在不同的状态下完毕单细胞系转录组混样解析

能够图标乳期甲壳宠物和浅海无脊柱甲壳宠物的原代神经细胞

我认为生殖神经细胞系软件测试是 “条件题”,那组织结构样板可是 “叠加题”, 许多样板并非因生殖神经细胞结构类型较为复杂、条件适用性唯一性,将成为符号水平的 “瓶颈问题”,而 HEATag 恰巧在许多 “瓶颈问题” 上凸显了优质。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸进行,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞往往能被合理辩别,很多通常体细胞类行的聚类分析法数据都清洗可辨。

更令人惊喜的是HEATag对浅海怪物的替换性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 方形码与种群转录组兼有较高同一性,没得显现因高盐的环境会导致的 “符号失灵”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可建立喂奶各种动物团队模板多沉 scRNA-seq 研究

Fig4: HEATag可保持鲜新海底无脊椎神经动物界诸多 scRNA-seq 分折

HEATag与体细胞的切合没诱发转录组的不错影响

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在做完标签主线任务的另外,没对后面的转录混合物析致使抑制,保障了论述数据信息的真正性。

Fig5: HEATag没有危害样本量的 RNA 表答状态

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今后可期

HEATag 能为单细胞膜理论研究分享是什么?

HEATag 的颜值,远不停于 “避免标注情况”,它的具备灵催化活性高性和普遍意义,也在为单生殖细胞科学研究打開一些概率性

从操作场合看你

HEATag 能扩大从 “十分简单十分解析”(如癌阻止与平常阻止、口服药工作与差表)到 “大企业面积调查”(如阻止癌上皮细胞图谱设计、mtk量需要)的全面积需要。现在 PIP-seq、Stereo-cell 等最新科技可延伸技能的成长 ,HEATag 还能加强组织领导一个脚印的提升单癌上皮细胞调查的通量,保驾护航成果转化精英团队开展业务更好企业面积的项目流程。

从跨领域行业竞争力来谈

HEATag 不光适宜于转录组学,还能与表观什么是基因组学、核蛋白质含量组学、区域空间组学等技艺搭配,利用个人定制数据库索引和寡核苷酸编码序列,HEATag 可放松融合各不相同的组学工艺流程,不决定数据信号捉捕淬硬层。与此同时,为HEATag还可成长单细胞系糖组学实验技艺。

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媒体合作动态性

拜谱怪物与陈凯专家实现目标进行初步企业合作意想

非常值得点赞的是,在 HEATag 水平出流露出硕大用发展空间的背景图下,拜谱生态学已与南方城市浅海生态学技术学与过程关东店南街实践室(北京)陈凯博士生导师达到目标系统化加盟意向但这并。夫妻之间规划努力实现 HEATag 水平的家产化立式、科技研究管理岗位转成等大方向发展深度的协同作战,确保一种效率率低、跨鱼类的单组织标识水平更好用于真正科技研究管理岗位场景中,为非常多实践室可以提供效率、划算的单组织设计专用工具,转向科技研究管理岗位岗位者在组织生态学学、浅海生态学学、皮肤疾病原则等邻域确认非常多达到
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